کبوترخانه در قدیم به عنوان جایگاهی برای حمایت از پرندگان بی پناه بوده و از کود پرندگان در این مکان، برای مصارف کشاورزی استفاده می‌شده است. برج کبوترخانه میبد در جنوب شرقی باروی قدیم میبد قرار دارد که اکنون محل فرماندهی میبد است. ارتفاع این برج حدود 8 متر است و با معماری اصیل یزد ساخته شده است. برج کبوترخانه  از قسمت بیرونی به صورت مدور است و در قمست داخلی سه طبقه دارد که هر کدام هزاران لانه برای جلب کبوترها دارند.