آقا باباخان یکی از قدیمی ترین حوزه های علمیه در شهر شیراز می باشد که در جنوب شرقی مسجد وکیل واقع شده است. عملیات ساخت بنا در دوره زندیه آغاز و در عهد قاجار تکمیل شد. حیاط آن مساحتی حدود 800 متر مربع دارد و دور تا دور آن 22 حجره یک طبقه برای طلاب قرار داده شده است. در حیاط مرکزی آن یک حوض سنگی و دو باغچه در دو طرف که درختان نارنج در آن کاشته شده است وجود دارد.